ישיבת קרני שומרון הידועה גם כקרנ"ש נוסדה בשנת ה′תש"מ ( 1980) שנתיים לאחר הקמת היישוב קרני שומרון. מנהלה הראשון היה הרב יעקב אליטוב ז"ל, לאחריו סא"ל (מיל.) יאיר הלר ועוה"ד משה גליק יבלחט"א. בשנה השלישית נבחר לנהל את הישיבה מר יגאל המאירי, פעל רבות להקמת קמפוס מפואר במרכז היישוב בו שוכנת הישיבה כיום. לאחר שביסס את הישיבה, פרש יגאל המאירי מתפקידו,  לאחריו המשיך אותו במרץ-רב ליאור ליפשיץ שהיה בוגר המוסד, וכיום מנהל את הישיבה אלימלך כהן בוגר המוסד.